Un proceso catabólico en el cual una cadena de ácidos grasos se separa en el carbono β (cada 2do carbono) por enzimas deshidrogenasas. Descompone ácidos grasos de cadena impar en acetyl-CoA y propionil CoA y ácidos grasos de cadena par solo en acetyl-CoA. Típicamente ocurre en las mitocondrias; la β-oxidación de ácidos grasos de cadena muy larga ocurre en los peroxisomas.